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陈实教授
来源:武汉大学药学院    时间:2011-11-30    编辑:admin    点击:78607

姓名: 陈实  Chen Shi)

职称: 楚天学者特聘教授  博士生导师 国家青年千人计划专家

通讯地址:湖北省武汉市武昌区东湖路185号(邮编:430071),武汉大学药学院

办公地址: 武汉大学本部测试中心四楼401
E-mail
shichen@whu.edu.cn

 

学习工作简历

1994 – 2000 华中农业大学生物技术六年制本硕连读专业。
2000 – 2004
获上海交通大学生物化学与分子生物学博士学位。
2001 – 2002
作为访问博士生赴韩国高等科技学院合作研究。
2005 – 2007
赴美国麻省理工学院进行博士后研究。
2007 – 2011
在美国哈佛大学进行研究工作。
2011 -
至今 武汉大学药学院教授。
  

业绩概要
以第一作者或通讯作者在Nature Chemical Biology, PNAS, Nature Communications, Medicinal Research Reviews, Trends in Cell Biology, Nucleic Acids Research, Chemistry & Biology等发表论文。
Microbiological ResearchBMC Systems Biology副主编,任Scientific ReportsFrontiers in Toxicogenomics编委,获邀JACSNucleic Acids ResearchMetabolic Engineering18个英文学术杂志审稿人。
相关研究成果被Nature Chemical Biology News and Views),Chemical & Engineering News Nature China ScienceDailyFaculty of 1000 等专门报道。

 

获奖情况

2016  中国微生物学会学术年会优秀学术论文奖
2015
 高等学校科学研究优秀成果奖自然科学一等奖
2015
  武汉大学医学部医学突出贡献奖
2014
  中国微生物学会学术年会优秀学术论文奖
2013
  湖北省医学领军人才培养工程
2013
  湖北省特聘专家
2012
  武汉大学医学部医学突出贡献奖
2012
  国家青年千人计划
2012
  湖北省楚天学者特聘教授
2008
  国家自然科学奖二等奖
2008
  新加坡陈嘉庚基金会第六届陈嘉庚青少年发明奖(上海)(铜奖)
2007
 《环球科学》2007年度全球十大科学新闻
2007
  上海市优秀发明奖选拔赛二等奖
2007
  新加坡陈嘉庚基金会第五届陈嘉庚青少年发明奖(上海)(铜奖)
2006
  上海市研究生学位论文优秀成果
2004
  上海市科技进步一等奖
2004
  上海市新长征突击手标兵
2004
  新加坡陈嘉庚基金会第二届陈嘉庚青少年发明奖(上海)(银奖)
2004
   明治乳业生命科学优秀奖
2004
  上海-联合利华研究与发展基金奖学金


研究兴趣与方向

1基因组修饰及编辑

利用最新发展的前沿技术,对细胞基因组进行精确地修饰和编辑,结合表观遗传学、基因组学、蛋白组学等,发展出特定设计的工程细胞,并解析这些表观遗传学修饰或基因组改造对细胞生命活动的影响。

2DNA骨架的磷硫酰化生理修饰

     与任何DNARNA修饰不同,DNA的磷硫酰化是DNA骨架上发现的第一例生理修饰,又称为DNA 骨架上的硫修饰,或DNA的第六元素。入选《环球科学》2007 年度全球十大科学新闻。磷硫酰化修饰由dnd 基因簇的一系列基因来完成,在不同的细菌宿主中表现出识别序列特异性,空间构象特异性。磷硫酰化修饰拓展了DNA的元素组成并丰富了DNA 结构,打开了一个新的学科领域。

3.创新药物的设计与改造

依据药物生物合成的机理及对重大疾病致病机理的认识,通过全面的病理分析,合理筛选并设计潜在药物,并通过前沿技术基因组编辑、合成生物学、基因工程、蛋白质工程、代谢工程及组合生物合成途径进行优化改造,发展相应的创新药物和治疗手段,以获得性能改善并可应用于临床的创新药物。

 

招生招聘

热情欢迎坚韧,进取,有理想,勤奋的硕博学生一起共同探索。欢迎有志于进入本课题组读研的本科生加入业余科研或定向培养。

诚聘细胞生物学,微生物学,生物化学与分子生物学,免疫学,生物信息学,创新药物的设计与改造方向博士后3名,为优秀博士后提供15-25万元年薪。

 招聘生物、药学、医学专业背景研究助理一名。

代表性学术论文

1.  Chen C, Wang L, Chen S, Wu X, Gu M, Chen X, Jiang S, Wang Y, Deng Z, Dedon P, Chen S*. Convergence of DNA methylation and phosphorothioation epigenetics in bacterial genomes. Proc Natl Acad Sci U S A, 2017, doi: 10.1073/pnas.1702450114. (*corresponding author)

2.      Cao B. #, Chen C. #, DeMott M.S. #, Cheng Q., Clark T.A., Xiong X., Zheng X., Butty V., Levine S.S., Yuan G., Boitano M., Luong K., Song Y., Zhou X., Deng Z., Turner S.W., Korlach J., You D.*, Wang L.*, Chen S.*, Dedon P.C. Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modification of short consensus sequences. Nature Communications, 2014, 5, doi:10.1038/ncomms4951. (*corresponding authors)

3.      Chen Y., Deng Z, Jiang S., Hu Q., Liu H., Zhou S., Ma W., Chen S.*, Zhao Y*. Human cells lacking coilin and Cajal bodies areproficient in telomerase assembly, trafficking and telomere maintenance. Nucleic Acids Research, 2014, 1-11, doi: 10.1093/nar/gku1277. (*corresponding authors)

4.      Wang L, Chen S*, Vergin KL, Giovannoni SJ, Chan SW, Demott MS, Taghizadeh K, Cordero OX, Cutler M, Timberlake S, Alm EJ, Polz MF, Pinhassi J, Deng Z, Dedon PC*. DNA phosphorothioation is widespread and quantized in bacterial genomes. Proc Natl Acad Sci U S A, 2011, 108 (7): 2963-2968. (*corresponding authors)

5.     Zou X#, Wang L#, Li Z, Luo J, Wang Y, Deng Z, Du S, Chen S*. Genome engineering and modification toward synthetic biology for the production of antibiotics. Medicinal Research Reviews, 2017, online March 15th. (*corresponding author)

6.  Deng Z, Purtell K Lachance V, Wold M, Chen S*, Yue Z*. Autophagy Receptors and Neurodegenerative Diseases. Trends in Cell Biology, 2017, online Feb 3rd. (*corresponding authors)

7. Wang L.*, Chen S.*, Xu T., Taghizadeh K., Wishnok J., Zhou X., You D., Deng Z, Dedon P. Phosphorothioation of DNA in bacteria by dnd genes. Nature Chemical Biology, 2007, 3(11): 709-710. (*co-first author)

各界评论:
(1)
《环球科学》2007年度全球十大科学新闻, 20081月刊:《发现DNA的第六元素》           
(2) Fritz Eckstein. Nature Chemical Biology
《自然化学生物学》, 新闻与视角, Phosphorothioation of DNA in bacterial. 2007, Nov; 3(11), 689-690.
(3) Carmen Drahl. Chemical & Engineering News
《化学与工程新闻》.  DNA Backbone Swaps In Sulfur – Common artificial DNA modification also occurs in nature. 2007, Oct 22: p14.
4) Felix Cheung. Nature China
《自然.中国》. DNA chemistry: Sulphur degradation. 2007, Oct 24: doi:10.1038/nchina.2007.223

8. Chen S.*, Galan M. C.*, Carla Coltharp, OConnor S. E. Redesign of a central enzyme in alkaloid biosynthesis. Chemistry & Biology, 2006, 13(11): 1137-41. (*co-first author) 

9. Chen S, Huang X, Zhou X, Bai L, He J, Jeong KJ, Lee SY, Deng Z. Organizational and mutational analysis of a complete FR-008/candicidin gene cluster encoding a structurally related polyene complex. Chemistry & Biology, 2003, 10(11): 1065-76.

10. Chen S. *, Mao X.*, Shen Y., Zhou Y., Li J., Wang L., Tao X., Yang L., Wang Y., Zhou X., Deng Z., Wei D.  Tailoring the P450 monooxygenase gene for FR-008/candicidin biosynthesis. Applied and Environmental Microbiology, 2009, 75(6): 1778-81 (*co-first author)

11. Chen S. *, Wang L., Deng Z*. Twenty years hunting for sulfur in DNA. Protein & Cell, 2010, 1(1): 14-21.  (*corresponding authors)

12. Wang L., Chen S., Deng Z. Phosphorothioation: an unusual post-replicative modification on the DNA backbone. Book Chapter. In DNA replication. 2011.

13. Wang L, Chen S, Xiao X, Huang X, You D, Zhou X, Deng Z. arsRBOCT arsenic resistance system encoded by linear plasmid pHZ227 in Streptomyces sp. Strain FR-008. Applied and Environmental Microbiology, 2006, 72(5): 3738–3742.

14. Mao X., Chen S., Shen Y., Wei D, Deng Z. Effect of copper sulfate on biosynthesis of FR-008/Candicidin complex production in Streptomyces sp. World Journal of Microbiology and Biotechnology, 2011, 27(9): 2033-2039.

15. Xu T., Liang J., Chen S., Wang L., He X., You D., Wang Z., Li A., Xu Z., Zhou X., Deng Z. DNA phosphorothioation in Streptomyces lividans: Mutational analysis of the dnd locus. BMC Microbiology. 2009, 20;9(1):41.

16. Zhou Y., Li J., Zhu J., Chen S., Bai L., Zhou X., Wu H., Deng Z. Incomplete beta-Ketone Processing as a Mechanism for Polyene Structural Variation in the FR-008/Candicidin Complex. Chemistry & Biology, 2008, 15(6): 629-38.

17. Yan B, Kong M, Chen S, Chen Y. VEGF stimulation enhances Livin protein synthesis through mTOR signaling. Journal of Cellular Biochemistry, 2010, 111(5): 1114-1124.

18. Mao X., Shen Y., Yang L., Chen S., Yang Y., Yang J., Zhu H., Deng Z., Wei D. Optimizing the medium compositions for accumulation of the novel FR-008/Candicidin derivatives CS101 by a mutant of Streptomyces sp. using statistical experimental methods. Process Biochemistry, 2007, 42(5): 878-883.

19. Zhou Y., Meng Q., You D., Li J., Chen S., Ding D., Zhou X., Zhou H., Bai L., Deng Z. Selective removal of the aberrant extender units by a type II thioesterase for the efficient FR-008/candicidin biosynthesis in Streptomyces sp. FR-008. Applied and Environmental Microbiology, 2008, 74(23):7235-7242.

20. Mao X., Wang F., Zhang J., Chen S., Deng Z., Shen Y., Wei D. The pH Shift and Precursor Feeding Strategy in a Low-Toxicity FR-008/Candicidin Derivative CS103 Fermentation Bioprocess by a Mutant of Streptomyces sp. FR-008. Applied Biochemistry and Biotechnology. 2009, 159(3):673-86

 

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